宠物进口者首先要通过传真、电子邮件或普通邮件在进境地澳大利亚动植物检疫局（简称AQIS）申请办理许可证，AQIS根据进口者的要求，把许可证A、B、C表传真或邮寄至指定的地址。A、B表可用复印件，为必填表；C表仅供无官方兽医国家使用。许可证有效期为半年。
品种要求：根据澳大利亚的环保法和海关的规定，不能进口大型生猛的猫犬，如巴西丝毛犬、日本土佐犬和斗牛犬等。
时间要求：宠物必须在澳大利亚确认的无狂犬病疫情的国家出生或生活3至6个月，怀孕宠物其怀孕期不能超过6周，且雌性动物不能在哺乳期。狂犬病流行国家的宠物要进入澳大利亚，必须让宠物在澳大利亚确认的无狂犬病疫情的国家生活6个月。
猫狗必须带有电子身份识别码。
官方检验检疫
进入澳大利亚的猫狗必须在出口国和澳大利亚接受官方兽医的检验检疫。由于不同的国家狂犬病流行情况不一，其检疫、隔离措施也有差异。
出口国的官方检疫
狗的布病、钩端螺旋体病、立克氏体病的检疫：所有的实验须在政府批准的实验室进行，实验结果填入许可证内。布病用凝集实验、钩端螺旋体病用微量凝集实验，当血清做1∶100稀释时低于50%的凝集为合格；立克氏体用荧光抗体实验，当血清做1∶40稀释时结果为阴性为合格。在无官方兽医也无狂犬病的国家，此项检验可在动物到达澳大利亚官方隔离场后进行。
躯体内外寄生虫：驱体外寄生虫主要为蜱、蚤，要求用外涂法或沐浴法，体内寄生虫用注射法驱绦虫、线虫，来自于非洲的狗在出口前28天内还需驱巴贝斯焦虫，且与驱外寄生虫时间间隔48小时以上，用双脒苯脲米松按7.5毫克/公斤皮下注射一次或6.6毫克/公斤间隔两周用药。官方兽医在许可证表上注明驱虫药的有效成分、剂量及驱虫日期。
检疫文件要求：出口国的官方兽医须在所有的实验报告、免疫证、许可证上签字，许可证还需加盖出口国官方兽医当局印章，除了在纸张破损处允许重写并需官方兽医签字外，任何情况下均不得涂改。所有这些文件必须随动物一并至澳大利亚供AQIS官员检查。检疫文件不符合要求的，动物只能退运。
运输条件要求：除导盲犬外，所有的动物进行航空运输时须用符合国际航空运输协会对活动物运输要求的笼具，即笼具应结实，能防止宠物逃逸，四周有通风孔，其通风面积不低于整个面积的16%，通风孔不能太大以防嘴或爪从孔中伸出，笼具应有足够大的空间，动物能自由站立、睡卧和转身；启运前须由官方兽医对笼具加封。导盲犬必须用绳子牵着，随残疾人一起入境。
官方检疫
澳大利亚口岸的现场检疫：来自任何国家的宠物必须提前通知到达地的AQIS，告知进境日期、时间、班次、运单号，以便AQIS官员到口岸及时施检。需进境隔离的猫狗只能从悉尼、墨尔本、珀斯三个口岸入境。
a. 不需官方隔离检疫的宠物的检疫：导盲犬及来自新西兰、椰子群岛、诺福克岛的宠物，经临床检疫健康，文件符合要求，在口岸对动物进行清洗消毒后放行，进入检疫监管一个月，在此期间不能与其他动物接触；在此期间，AQIS官员将有权随时对动物进行检查，如果文件不符合要求则退运或进入隔离场隔离检疫。
b. 需进行隔离检疫的宠物的检疫：除了新西兰、椰子群岛、诺福克岛的宠物外，其他国家的宠物经临床检疫健康，文件符合要求，对动物进行清洗消毒后，直接由AQIS的车将动物运抵澳大利亚的官方隔离场隔离检疫；文件或健康不符合要求的，则拒绝入境。
隔离检疫：因动物来源国不同，隔离检疫期从1个月至6个月不等，隔离检疫期间允许畜主至隔离场探望宠物，隔离检疫期满，畜主应及时接走其宠物。
